Manis Pahitnya Penelitian... (part1)

Sebagai Mahasiswa tingkat akhir, apalagi yg ngambil jurusan eksak, maka research is a must. without it, we'll never graduate from college.di jurusan nisa,pas taun terakhir qt ada pembagian lab gt, fungsinya wat spesialisasi aj siy. kebetulan NIsa ambil Lab BIokimia.

Ga banyak orang bersedia menjatuhkan pilihannya pada Lab Biokimia. Alasannya standar, karena orang2 lab BIokimia lama lulusnya . wajarlah, penelitian dengan makhluk hidup g bisa diprediksi. Qt ga bisa ngatur objek penelitian qt untuk sesuai dengan kehendak qt. yang ada adalah, qt menyesuaikan diri dengan objek penelitian qt dan berusaha mengkondisikan objek penelitian qt sesuai dengan habitat asalnya, sehingga objek penelitian qt merasa nyaman dan tdk beranggapan bhwa dy adalah kelinci percobaan (hihihi, hak asasi objek penelitian niy...).

Nisa sendiri punya objek penelitian yg unik, namanya Bakteri. Tapi bukan sembarang bakteri, karena bakteri ini bakteri thermofil, bakteri yg hidup pada suhu ekstrim, khusus bakteri nisa dya tahan pada suhu tinggi. Bakteri ini diambil dari sumber air panas Gedong Songo Ungaran.

Tujuan Penelitian NIsa adalah menemukan spesies baru dari bakteri yg hidup di Sumber air panas Gedong songo. Karena ternyata data yg ada di Gene Bank (Bank data spesies DNA), Bakteri yg ada di Gedong Songo itu khas dan blum banyak yg meneliti. Padahal, Bakteri tersebut memproduksi enzim2 yg punya kelebihan, yaitu tahan terhadap suhu tinggi. kan Normalnya enzim tdk tahan suhu tinggi. Makanya kita melakukan riset terhadap bakteri ini.

Perjalanan dimulai dari sampling di Sumber Air Panas Gedong Songo. Ini dilakukan pas akhir Januari sebelum berangkat KKN. trs bakteri ditumbuhkan dalam media yg sudah diberi Pengkayaan YT (Yeast Tripton) dan diinkubasi pada suhu 55 derajat Celcius. setelah timbul kekeruhan, bakteri dipanen dan disimpan dulu dalam kulkas, soalnya bakal ditinggal 35 hari wat KKN.

Selesei KKN, Back to Lab again. Nisa mulai merefresh bakteri, karena bakteri uda terlalu lama berhibernasi di kulkas. trs ditumbuhin dimedia padat wat mendapatkan single koloninya. setelah dapat single koloninya, kembali diperbanyak di media cair. Jadi dari pertengahan maret mpe april, kerjanya numbuhin bakteri mulu. keliatannya mudah, tapi subhanallah, susaaaaaaaahhhhh bgt. Karena bakteri tu makhluk yg rentan. klu mood kita g baik, kita sakit, tergesa2 dijamin tuh bakteri g bakal tumbuh.

sambil nunggu bakteri numbuh, Nisa melakukan identifikasi konvensional dengan pewarnaan gram. untuk mengidentifikasi minimal meyakinkan bahwa bakteri yg tumbuh adalah bakteri yg kita inginkan diliat dari jenisnya (klu Thermus Nisa tu gram negatif). dan cobaan itu selalu datang, subhanallah ngiden pake mikroskop susa bg6t cing... mata uda jereng2, melotot2 g jelas mpe sakit tetep aj g bisa kelatan jelas... mana masi pke mikroskop yg manual lg,,, nasib de, kuliah ditempat yg fasilitasnya minim.

Mpe bulan Mei, masiy sibuk dengan agenda numbuhin bakteri dan memperbanyak. Nisa sempet strees brat, karena bakteri g numbuh2, pwarnaan gram g berhasil2 . Pertengahan mei, alhamdulillah bakteri numbuh. kemudian dihadapkan pada permasalahan baru, reagen kit yg akan digunakan untuk ekstraksi DNA nya akan expired mpe akhir mei !!!  GAWAATTT!!! padahal reagennya mahal bgt pol... yauda 2 minggu sebelum akhir mei, qt mulai latihan mengekstraksi DNA.

Ektraksi DNA dilakukan untuk mendapatkan DNA dari bakteri untuk analisis selanjutnya. banak bgt reagen yg dipake. semua pke skala mikro. pertama2 bakteri di sentrifuse wat mendapatkan pellet selnya. karena bakteri Thermusnya kekeruhannya g terlalu keruh, waktu yg kita pke wt mensentrifuse aja uda 4 jam sendiri... jadi dari pagi jam 6 qt preparasi, sterilisasi alat dan lain2, trs mensentrifuse dan baru kelar sekitar dhuhur. Dah gt pellet sel yg terkumpul cuma dikiiiiitttttt bgt... BIs itu mulailah mengekstaksi DNA. semuanya dilakukan kira2 mpe 1/2 5 sore baru rampung. trs setelah di peroleh ekstak DNA, kita lanjutkan dengan elektroforesis DNA. Fungsinya untuk mengetahui apakah ada DNA nya apa tidak, karena DNA itu molekul yg amat KECIIIIILLLLLL sekali. jadi perlu dicek d keberadaannya.

NUnggu 2 jam nge running wt elektroforesis DNA, trs dilihat hasilnya dibawah lampu UV, apakah ada Mark DNAnya apa g. Dan ternyata HASILNY NIHIl..... g ada jejak DNA yg tertinggal. Dari pagi mpe malem yternyata hasilnya g ada....dan gt terus mpe berkali2. akhirnya dicoba pke bakteri e Colli. dan ternyata berhasil. Minimal selama ini metode ekstraksi yg dilakukan g salah. dan itu uda pengulangan ke 6....

Karena Reagen ud kadarluarsa, akhirnya bulan juni Nisa latihan ekstraksi DNA menggunakan reagen lain, yg lebih banyak lag, kareana reagen kali ini buatnya manual. dan kembali lg qt ekstraksi DNA untuk uji coba reagen. dan Bakterinya Kembali ngambek lagi, tiba2 g mau tumbuh. Duh, klu g tumbuh gmn mau ekstrasksi DNA. Akhirnya sepanjang Juni - Juli kerjanya numbuhin Bakteri lg, ngerefresh bakteri lagi...

_to be continued_